De vzw wordt bestuurd door een raad van bestuur.
Het vernieuwde bestuur is in handen van vertegenwoordigers van de zogenaamde “korte keten”, bestaande uit vier deelgroepen : de fokkers , de sperma wincentra, de varkenshouders en de slachthuizen.
De dagelijkse leiding is in handen van de manager. Hij wordt bijgestaan door de secretaris en de technische medewerkers.
De huidige raad van bestuur van VPF telt 8 leden:
Bohnen Bert, voorzitter, afgevaardigd door BB, Dilsen-Stokkem
Blomme Isabelle, ondervoorzitter, VPF fokker, Pittem
Gorssen Neel, VPF fokker, Kaulille
Ceyssens Marc, afgevaardigd door VVKIC, Eksel
Dewispelaere Chris, afgevaardigd door VVKIC, Evergem
Vergote Bart, afgevaardigd door ABS, Zedelgem
Coenegrchts Jan, afgevaardigd door Febev, Linden
Hindryckx Henk, afgevaardigd door Febev, Westrozebeke